大气 – 海洋系统是地球的大气圈与占地球面积71%的海洋相互作用、相互影响构成的系统。大气与海洋有各自独立的运行和演化规律，又有密不可分的联系。本平台旨在借助超级计算机对大气、海洋等各种活动进行建模和分析，预测气候变化，防范和减轻气候变化带来的破坏。
大气：研究模拟尺度从大到小粗略分为全球大气，气候，天气，城市污染气体，气体泄漏与火灾。软件使用的方法大致为FEM或FVM配合流体力学知识。部分软件需要定时输入实时数据作为边界条件。 目前该分类软件按研究尺度从大到小有： CESM，WRF，CMAQ，Fds。
海洋：尺寸从大到小分为全球洋流，海洋局部，江河入海口。软件使用方法多为基于流体力学知识的FVM，采用非结构网格法建立网格。对海洋的模拟直接与我国多种经济行业相关，如：江河口疏浚，海港建设，潮汐能开发，海洋水体污染治理，渔业分布，洋流对气候影响，海冰对气候和航线的影响等。 目前该分类软件按研究尺度从大到小有：CESM，FVCOM，ELCIRC。
| 分类 | 软件名称 | 版本 | 免费开源/商业 | 软件功能特点 |
|---|---|---|---|---|
| 数值天气预报与研究 | WRF | 3.6.1, 3.6.0, 3.5.1 | 免费开源 | 天气预报 |
| 海洋 | WAVEWATCH III | 4.18 | 免费开源 | 海洋，波浪模型 |
| 海洋 | FVCOM | 3.2.1 | 免费开源 | 非结构网格，有限体积法，自由表面 |
| 海洋 | ELCIRC | 5.4c | 免费开源 | 海岸，有限体积，非结构网格 |
| 大气环境 | CMAQ | 5.0.2 | 免费开源 | 空气污染 |
| 工具 | Salome | 7.4.0 | 免费开源 | 前、后处理 |
| 地理 | OpenFOAM | 2.1.1 | 免费开源 | 计算流体力学，（CFD）类库 |
